Панель "Наследственные эпилепсии"

Исследование, направленное на определение мутаций более 550 генов, ассоциированных с наследственными эпилепсиями.

Эпилепсии – гетерогенная группа заболеваний, характеризующихся повторными, спонтанно возникающими приступами. Согласно статистике, эпилепсия встречается с одинаковой частотой во всем мире и независимо от расы около 0,5-1% населения страдают этой болезнью.

Основным симптомом эпилепсии являются эпилептические приступы. Эпилептический приступ возникает в результате нарушений процессов возбуждения и торможения в клетках коры головного мозга. Эпилепсии полиэтиологичны. Важную роль в их генезе принадлежит генетическим факторам, далее следуют пре- и перинатальные поражения нервной системы, дегенеративные заболевания ЦНС, опухоли мозга, черепно-мозговые травмы и сосудистые заболевания мозга.

Вклад генетических факторов в развитие эпилепсии достаточно высок и составляет 70-80% от всех случаев. Мутации более чем в 400 генах приводят к развитию этого заболевания и еще более 1500 генов связаны с синдромами, имеющими судорожные проявления. Среди них:

1. Идиопатические генерализованные эпилепсии (ранние эпилептические энцефалопатии, прогрессирующие миоклонус эпилепсии, юношеская миоклоническая эпилепсия и др.);

2. Наследственные синдромы, сопровождающиеся судорогами (синдром Айкарди-Гутьерес, синдром Корнелии де Ланге, синдром Ангельмана и др.);

3. Болезни нарушения обмена веществ (болезни гликозилирования, пероксисомные болезни и др.);

4. Пороки развития головного мозга (фокальные корковые дисплазии, голопрозэнцефалия, лиссэнцефалия и др.);

5. Нейродегенеративные заболевания (нейрональный цероидный липофусциноз, лейкодистрофии, лейкоэнцефалопатии с исчезновением белого вещества и др.);

6. Митохондриальные болезни.

Панель "Генетические эпилепсии" включает анализ генов, связанных с синдромами, одним из признаков являются судорожные состояния. Это могут быть как синдромы в симптоматике которых судороги являются единственным или ведущим признаком, так и синдромы, в которых также имеются и другие неврологические (задержка развития, аутизм, изменения структур головного мозга) и не неврологические нарушения (аномалии развития, нарушения обмена веществ и др.).

Гены, включенные в панель, отобраны на основе глубокого анализа общих (OMIM, ClinVar, CCDS, Ensembl, GENCODE, miRBase, RefSeq, VEGA) и специализированных (GenEpi, CarpeDB, epiGAD, The Lafora Gene Mutation Database, MeGene) генетических баз данных. В панель также включены некоторые гены-кандидаты, связь которых с эпилепсией вероятна, и гены, ответственные за коморбидные заболевания с задержкой развития, расстройствами аутистического спектра, синдромом дефицита внимания и гиперактивности.

Виды генетических изменений, определяемых панелью "Генетические эпилепсии":

1. Однонуклеотидные и мультинуклеотидные варианты (SNV и MNV) в экзонах всех клинически значимых генов;

2. Малые вставки-делеции (in/del) до 50 пар нуклеотидов в экзонах всех клинически значимых генов;

3. Вариации числа копий генов (CNV), такие как делеции/микроделеции и дупликации/микродупликации среднего и крупного размера (с ограничениями).

Исследование выполняется методом секвенирования нового поколения (NGS). NGS является наиболее современным методом генетического исследования со средним числом прочтений каждого участка генома не менее 70x (это означает, что каждый участок генома прочитывается в среднем не менее 70 раз для снижения влияния технических ошибок сиквенса на результаты исследования). При секвенировании генов, включенных в панель "Наследственные эпилепсии", вероятность обнаружения причины заболевания составляет 20-45%.

Обратите внимание, имеются ограничения! Метод не выявляет генетические варианты в повторяющихся вариантах генома (гены, имеющие псевдогены, паралоги, сегментарные повторы). Точность метода, также снижена в сложных участках генома (GC богатые и poly-n участки).