Диагностика методом ОТ-ПЦР на рота-, норо-, астровирусы одно исследование на всю группу
Исследование, направленное на качественное определение генетического материала (РНК) ротавируса группы А (Rotavirus A), норовирусов геногрупп 1 и 2 (Norovirus G1 и G2), астровируса (Astrovirus) в кале методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР).
Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты).
Согласно официальной статистике, большой процент заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается.
Норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является "золотым стандартом" в клинической диагностике норовирусных инфекций.
Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.
Астровирусы, несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, составляют значительный пласт кишечных инфекций. У трети пациентов протекает с явлениями колита.
Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить этиологию кишечного заболевания в виду исследования генетического материала возбудителей в кале. Быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.
Наиболее чувствительным и специфичным методом выявления возбудителя герпес-вирусных инфекций является полимеразная цепная реакция (ПЦР), которая позволяет определить генетический материал (РНК) возбудителя даже при небольшом количестве вирусных частиц в биологическом материале.
- Кал
- Для исследований предпочтительно использовать утреннюю порцию фекалий.
- За 2 дня до исследования кала нужно отменить (по согласованию с врачом) следующие препараты: слабительные, активированный уголь и другие энтеросорбенты, препараты висмута, железа и препараты, вводимые в ректальных свечах, приготовленных на жировой основе.
- Запрещается собирать кал в период менструации или в течение 3 дней до или после нее.
- Запрещается собирать кал из подгузников, после клизмы, при наличии кровоточащих геморроидальных узлов, кровоточивости при длительных запорах, с примесями мочи или выделений из половых органов, в течение 2-х дней после проведения рентгенологического исследования желудка и кишечника с использованием контрастных препаратов.
- Испражнения собираются из разных мест специальной лопаточкой вмонтированной в крышку контейнер, в объёме примерно 1/3 контейнера.
- Кал собирается после естественной дефекации в чистую ёмкость.
- Нельзя отбирать пробу из унитаза.
- Кал
- Для исследований предпочтительно использовать утреннюю порцию фекалий.
- За 2 дня до исследования кала нужно отменить (по согласованию с врачом) следующие препараты: слабительные, активированный уголь и другие энтеросорбенты, препараты висмута, железа и препараты, вводимые в ректальных свечах, приготовленных на жировой основе.
- Запрещается собирать кал из подгузников, после клизмы, при наличии кровоточащих геморроидальных узлов, кровоточивости при длительных запорах, с примесями мочи или выделений из половых органов, в течение 2-х дней после проведения рентгенологического исследования желудка и кишечника с использованием контрастных препаратов.
- Испражнения собираются из разных мест специальной лопаточкой вмонтированной в крышку контейнер, в объёме примерно 1/3 контейнера.
- Кал собирается после естественной дефекации в чистую ёмкость.
- Нельзя отбирать пробу из унитаза.
1. Установление этиологического фактора острой кишечной инфекции
2. Дифференциальная диагностика причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ)
Результат исследования должен оценивать лечащий врач, учитывая дополнительные клинические, инструментальные и лабораторные данные.
«Обнаружено» – в анализируемом образце биологического материала обнаружены фрагменты РНК, специфичные для Rotavirus A, Norovirus G1, G2 и/или Astrovirus. При наличии соответствующих клинических проявлений это свидетельствует об этиологической роли выявленного вида возбудителя (Rotavirus A, Norovirus, Astrovirus).
«Не обнаружено» – в анализируемом образце биологического материала не найдены фрагменты РНК, специфичные для Rotavirus A, Norovirus G1, G2 и/или Astrovirus, или концентрация РНК возбудителя в образце ниже границы чувствительности теста.